そこで、私たちが実際に行った順番は
・　妻の転出届けを事前に申請（これは、実際に転出する2週間前から届出ができるので、先に行うと楽です。）
・　入籍届けを役所に提出（申請が都合によって休日であったため臨時窓口になりました。ちなみに午後5:55の受領でした^^;）
・　新住所と戸籍が違うので、翌日、新住所の役所に転入届を提出。この際、少し待つだけで戸籍入りの新たな住民票が取得できました。（事前の情報ですと、戸籍がデータに反映されるまでに2週間程度必要なことがあるそうです。きっと住基ネットなどの問題もあるかもしれません。）
・　住民票に戸籍が記載されたので、新たな戸籍謄本が取得できると考え、戸籍のある役所に行き確認すると、新たな戸籍謄本が発行されました。
・　もし戸籍謄本への反映に時間がかかる場合、代わりに婚姻受理証明書（入籍届けの時に発行してもらう）と旧戸籍抄本または除籍抄本の提出をします。そのため、入籍前にこれらの書類を用意しておく方が良いです。
・　パスポート申請の際に身分証明書が必要ですが、免許証などの訂正が間に合わない場合、婚姻の事実が分かるもの（戸籍謄本で大丈夫なはずです）と旧姓の証明書で大丈夫です。

　以上のように、私たちの場合は入籍（休日）日の翌日には書類が揃いました。しかし、これはきっと最短のケースだと思います。一般に結婚式後に入籍、直後に新婚旅行の場合では、旧姓のパスポートを使用するケースが多いようです。